产品介绍
由中国现代水产海产品合理设计院生物工程技木应用设计主李炯棠设计创业团队联办与深圳康普森渔业高新科技十分有限我司发掘了市场上最适合于鲤研发、新品种检验等经不同的用途的表观遗传生物育种心片
——“鲤育一號”(图2)。该心片包括了20K个高品效果的SNP位点,为鲢鱼房产提质对标管理,研发创新型、栽培、耐粗、高抗、耐密等优秀相对性状的鲢鱼优种带来强力的技木应用的支撑。
“鲤育1号”分为康普森CAGT(®)靶向治疗捕捉测序枝术,含带16种主养鲢鱼的全dna组重测序变种和极为重要性区域经济物理性质关连标出。“鲤育1号”集成ic位点所覆盖全dna组进行繁育不确定性分析大的位点和包扩多种类鲢鱼社会群体多态性标出。该集成ic含带鲢鱼健康的品质物理性质(粗核蛋白、粗蛋白质细胞、氨基、蛋白质细胞酸、肩部肌肉质构、肌间刺、纹段等)、血营养成分及浓度、性別等物理性质的原子标出18056个,最后还涉及到差别16种鲤类型炎症因子聊天位点144个,可在极为重要性物理性质的繁育值可能和类型确权保护措施。经由模板集成ic测试方法,“鲤育1号”集成ic,类新食品位点验出率高,均值验出率实现了95.18%,类新食品安全平稳性分析好、dna型较准高,重叠模板均值分型同样比率98.77%,类新食品耐热性品质。
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企业产品数据信息
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核心参数表
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“鲤育1号”繁育处理芯片
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记号个人信息
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标记符号种类
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SNP
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箭头总量
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20359
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鲤鱼营养品质性状、血液成分及含量、 性别等性状功能位点
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18056
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优良品种鉴别位点
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144
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技术工艺类
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康普森CAGT®靶向疗法捉捕测序新技术
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参阅基因遗传组
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GCF_018340385.1
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数据表现
“鲤育一号”— 染色体分布情况
鲤鱼(Cyprinus carpio)作为异源四倍体鱼类,各由25条染色体组成。该芯片囊括了A亚基因组和B亚基因组的鲤亚基因组水平的变异,为在四倍体背景下开展重要经济性状遗传解析,进行基因组选择育种技术创新提供了新的视野。
图1 芯片位点在染色体上(A基因组和B基因组)的分布图
“鲤育一号”育种芯片 — MAF分布
图2 芯片位点MAF分布
“鲤育一号”育种芯片 — 位点注释情况
图3 芯片位点注释情况
“鲤育一号”育种芯片 — 分型一致性
图4 重复样本分型一致性
通过对3组重复样本进行分型,显示平均一致率达98.77%。
以上结果表明,鲤育一号位点选择合理、变异丰富、一芯多用(育种、品种鉴定、功能位点因果检测),芯片设计出众,分型结果表现优异,能够满足大量样本的检测需求。