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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全人类表观隐性基因组低淬硬层重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是再生利用较低淬硬层（~1×）的重测序数据信息显示显示展开隐性表观隐性基因突变表观隐性基因分型，后完成人类表观隐性基因型添加，将低溶解度数据信息显示显示添加为高溶解度人类表观隐性基因型数据信息显示显示。LcWGS 不用办理设备开发建设，测序成本费用低，会添加全人类表观隐性基因组隐性表观隐性基因突变，更极为有方便大的规模范本的遗传性状追踪定位及 GS 生物育种应运。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可换取全DNA组的遗传病变种
  • 高性价比
    以超低的测序成本费低，获得了高孔隙率的标上，论文检测速率高
  • 大群体
    样本检测
    可用到大目标群体的什么是基因型加测及的研究
  • 分型
    准确性高
    特征提取添加java算法，分析精确率相当于98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS遗传性状定位功能及GS最后更
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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