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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全隔代隐性基因人类什么是DNA组低淬硬层重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是凭借较低淬硬层（~1×）的重测序统计资料资料库做出隔代隐性基因突变临床表现，随后进行隔代隐性基因人类什么是DNA型选中，将低比热容统计资料资料库选中为高比热容隔代隐性基因人类什么是DNA型统计资料资料库。LcWGS 不须系统激发，测序代价低，要抓取全隔代隐性基因人类什么是DNA组隔代隐性基因突变，更有好处于大经营规模样表的物理性质定位系统及 GS 生物育种操作。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可拿到全基因基因组的基因变种
  • 高性价比
    以超低的测序利润低，可以获得密度高计算的标记符号，验测的高效率
  • 大群体
    样本检测
    采于大团队的遗传基因型监测及深入分析
  • 分型
    准确性高
    依托于填冲神经网络算法，分析精确度率多达98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS物理性质准确定位及GS成果相对
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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