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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全人类dna人类dna组低深层重测序(Low coverage WGS,LcWGS)指的是合理利用较低深层(~1×)的重测序的参数做好人类dna突变临床表现,接下来依据人类dna人类dna型充实,将低容重的参数充实为高容重人类dna人类dna型的参数。LcWGS 需不需要体系研发,测序直接费用低,并能拿全人类dna人类dna组人类dna突变,更有效于大的规模样例的特性固定及 GS 生物育种用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可刷快全什么是基因组的遗传的遗传变异
  • 高性价比
    以太低的测序投资成本较为低廉,收获高比热容的标上,加测工作压缩效率高
  • 大群体
    样本检测
    常代替大消费群的遗传基因型检查及研发
  • 分型
    准确性高
    依托于粘贴百度算法,分析准确性率相当于98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS相对性状位置及GS没想到有点
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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