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罗氏沼虾
罗氏沼虾
产品介绍
在我国渔业完美深入分析院珠江渔业深入分析所淡水区虾表观dnadna规律制种科学创新组于凌云教授深入分析团体与杭州康普森农耕科技发展有限责任公司协议,合理充分使用康普森CAGT®靶向药物药物获取测序技木,产品研发了极具数字化小知识房屋产权的罗氏沼虾200K靶向药物药物获取制种处理芯片“臻珠2号”。“臻珠2号”极具表观dna组涵盖多方位、价格低、视觉效果优、准确性率等优缺点,可app于罗氏沼虾表观dnadna规律多样化性评诂、种质市场评定、性能表观dna分析以其表观dna组抉择制种等深入分析,可称罗氏沼虾表观dnadna规律种质市场的规划设计与合理充分使用供给全新的原子设备。合理充分使用“臻珠2号”可培肓罗氏沼虾的楼盘新茶叶品类,进两步降低了育种价格,为培肓萌发快、抗病性(逆)强、的质量好的罗氏沼虾楼盘新茶叶品类逐步形成基础条件。
集成块相关信息 重中之重主要参数 臻珠5号
标出信息查询 标志多种类型 SNP
标志个数 200000
技能位点 22
测序类种 差异省份由来的237只罗氏沼虾
表1 “臻珠1号”育种芯片位点组成及分布数量
应用方向
罗氏沼虾遗传多样性评估
罗氏沼虾种质资源鉴定
罗氏沼虾全基因组选择育种
罗氏沼虾全基因组关联分析
数据表现
研究团队先后在越南、缅甸、斯里兰卡、浙江、江苏、广西和广东等8个区域收集罗氏沼虾237只。为获得充足可供挖掘的基因组遗传变异位点,对这些样本开展了高深度重测序工作,最终获得24,421,454个SNP位点。在这些数据的基础上,结合研究团队前期研究得到的22个个体鉴定位点,最终筛选出200,000个罗氏沼虾核心SNP位点,这些位点均匀地分布在59条染色体上(图1),并表现出较高的遗传多样性(图2)。使用重测序得到的位点和臻珠1号的200K位点对部分样品分别进行聚类分析,结果显示样本聚集情况在二者中表现基本一致(图3),说明该芯片可较好地代表群体原始状况。
图1 臻珠1号SNP位点在染色体上的位置分布
图2 臻珠1号SNP位点的MAF分布

图3 不同位点集的进化树结果(上图200K,下图所有位点)